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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T上皮内部并能判断肺部肉瘤上皮内部外观的基本策划 相溶性和好体(MHC)呈递的抗原而打断免疫细胞系性細胞反响。MHC I类(MHC-I)碳原子与CD8+ T上皮内部彼此的功效,其呈递的肽基本來缘于内源性胞质核血清的核血清酶体光可降解,而MHC II类(MHC-II)碳原子基本形容于专业化抗原提呈上皮内部,与CD4+ T上皮内部彼此的功效,其呈递的肽根据根据内体手段光可降解的胞外和胞内核血清(图1)。之所以,判断由MHC碳原子呈递的肺部肉瘤抗原针对设计制作依赖于T上皮内部判断和消除肺部肉瘤上皮内部的合理和安全保障的肺癌免疫细胞系性細胞療法是至关主要的。针对质谱(MS)的免疫细胞系性細胞肽组学(Immunopeptidomics)并能从多种类上皮内部系、肺部肉瘤策划 和良好策划 中mtk量、之间认定MHC切合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC简答结合起来肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫力肽编码序列各类泰语翻译后装饰个人信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头开始测序新技术,不依赖现有数据库,会高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且高的资料定性分析信息内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递良性肿瘤抗原的经由

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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实例分享

01 机理探究

篇文章试题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

刊发杂物:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一个种核工作输出核蛋白,在癌症晚期中一直过表达出来,做以为肉瘤有的动力情况。如今,靶向治疗XPO1的小碳原子正被用到临床试验治癌肿瘤药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 一个源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 良性肿瘤-免疫力调理

散文题目大全:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发稿自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023

恶变胸膜间皮瘤(MPM)不是种生存率不好的肉瘤样癌性肺部肿瘤。在当前的控制计划方案欠缺较果,所以急切须得新的控制原则。由此可见其T肿瘤细胞浸润性,小说家假设检验MPM不是个适用的控制性癌证狂犬疫苗的梦想。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用通过质谱的免疫性肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤免疫抗体肽组学探测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 螨虫mRNA肺炎疫苗开拓

散文考题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

展现杂物:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过依据质谱的免疫性肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌细菌感染的Hela细胞膜系和HCT-116细胞膜系中监定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱工作小结

免疫系统受损受损细胞系统力检测力性肽组学是淀粉酶质组学的个很快趋势的树状,它认准于研发免疫系统受损受损细胞系统力检测力性整体中由常见策划 相溶性分手后复合体(MHC)或人类红肿瘤受损受损细胞核系抗原(HLA)分子式呈递的免疫系统受损受损细胞系统力检测力性肽。这部分免疫系统受损受损细胞系统力检测力性肽是肿瘤受损受损细胞核系外面呈递的肽段,可被T肿瘤受损受损细胞核系区分,而使启用免疫系统受损受损细胞系统力检测力性的反应。针对质谱的免疫系统受损受损细胞系统力检测力性肽组学都已经 当上亲子鉴定会MHC淀粉酶呈递肽的金原则具体方法,可就直接亲子鉴定会不相同生理性和疾病程序下不相同策划 和肿瘤受损受损细胞核系类型、中的免疫系统受损受损细胞系统力检测力性肽组,譬如实体线瘤或病毒是什么感动的肿瘤受损受损细胞核系。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫加测肽组加测业务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,并能正确且就直接具备免役肽编码序列,发现了越多非典型性免役肽,逐渐选择出安全可靠新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

基准论文

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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