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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核海洋生态学mRNA中最必要要的转录后修饰语,在真核海洋生态学的方面的问题和女性生理时候中起着至关必要的反应。血糖高认同思维障碍就是种不可逆反应的运动神经末梢运动神经模式退行性病症,现成长确凿切长效机制并未全揭示,还有就是缺泛有效地的杜绝和医疗行为。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱海洋生物为其提供m6A甲基化分折技术工艺功能,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

软文种类:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

朋友院校:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

实验物料:小鼠脑组织

拜谱供应技术水平:m6A甲基化(MeRIP-seq)

内容提要图:

图1| 结语图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

的研究最后

1.DCI小鼠海马中m6A表观遗传掩盖的转换

钻研专业人群最先建造了高脂食用和群体行为缺陷(DCI)的小鼠模形。为较较组(n = 3)和DCI组(n = 3)左右的m6A染色体组呈现,钻研专业人群适用MeRIP-seq开展了转录组范围内内的m6A-seq数据分析。在DCI组的10664个商品编码染色体组转录物(mRNAs)中国国民党显示较组的2374个不交叠的m6A峰。相较一样,DCI组表现形式出23,77个非交叠m6A峰。这之中,9347个甲基化染色体组在较组和DCI组左右交叠(图2)。

图2| 對照组和DCl组m6a体现表观遗传的维恩图

共检验出1276个差别的甲基化的m6A位点(DMMSs),进来60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化水平面分离偏态过于对应组。定性分析其划分情況察觉m6A峰划分在一整块RNA中(图3A),并按照其其划分的转录部位中可分为下面五组:5'UTR、3'UTR、转录起止位点部位中场面、中止密匙子场面、起止密匙子场面和商品代码字段(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和中止密匙子左右偏态丰度(图3B)。为了更好地评诂许多着色体上m6A表达的部位中,设计考生建立了有峰注脚的部位中,并测量了许多着色体上reads的扩大率。在DCI组中,m6A表达区侧重于3'UTR区(图3C)。所以mRNA内的DMMS都被位置定位到着色体往上面评诂其划分概述。多种小鼠着色体的m6A表达谱多种。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的修改

要想产品检验m6A遮盖在DCI小鼠中的动物学系统,概述一下师从2组数中择含有DMMS的球蛋白编码查询dna开始GO和KEGG概述一下(图4A)。在GO概述一下中,高甲基化dna在上皮血细胞膜系进程、动物进程宏观调控、离子液体亲水性和杂环氧化物根据中重要聚集。KEGG数据电磁波电磁波通道概述一下提示,高甲基化dna与T上皮血细胞膜系多巴胺肾上腺素受体数据电磁波数据电磁波电磁波通道、小上皮血细胞膜系肺腺癌和RIG-I样多巴胺肾上腺素受体数据电磁波数据电磁波电磁波通道有关于(图4B)。而言低甲基化dna,GO概述一下提示在上皮血细胞膜系进程、新陈代谢进程和根据进程中重要聚集有机质环氧化物、根据杂环氧化物和离子液体亲水性(图4C)。KEGG数据电磁波电磁波通道概述一下具体分析了低甲基化dna与肥厚性心肌病和Hippo数据电磁波数据电磁波电磁波通道的连接(图4D)。

图4| 对比分析甲基化m6A位点的径路生物富集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据研究的联动研究

接着随后探析相关人员将m6A MeRIP-Seq的参数和已经RNA-Seq的参数做出联合技术探讨,发展163个mRNA,m6A峰和mRNA标准相关性改动。41种mRNA的m6A和mRNA标准调整,14种mRNA标准下跌。不仅而且,30个染色体mRNA表述调整,m6A标准下跌,76个染色体mRNA表述下跌,m6A标准调整(图5A)。第四,打造没事个PPI网上来表明163个染色体编码查询的蛋白酶中间的连接方式(图5B)。

如下图6如图是,GO和KEGG具体探讨一下主要包括四组:(1) m6A调涨,mRNA降低;(2) m6A调涨,mRNA调涨;(3) m6A降低,mRNA降低;(4) 表观遗传m6A降低和mRNA调涨。在GO具体探讨一下中,m6A调涨和mRNA降低的表观遗传在人体細胞膜消化吸收环节、果香族类化合物生物制品转化成环节和RNA消化吸收环节的监测中偏态聚集。KEGG具体探讨一下表现,他们表观遗传在蛋白酶质酸消化吸收、小人体細胞膜肝癌、丙酸消化吸收和甲苯酸消化吸收中聚集。就m6A调涨和mRNA调涨的表观遗传,GO具体探讨一下表现在亚铁联系、亚胺丙氨酸脱羧酶特异性酶类、天冬氨酸1-脱羧酶特异性酶类和人体細胞膜接触装设负监测中聚集;KEGG具体探讨一下表现在2型血糖值高的、蛋白酶质人体細胞膜细胞因素4g的讯号通道和胰岛素4g的讯号通道中聚集。在GO具体探讨一下中,m6A降低和mRNA降低的表观遗传在寡肽联系、谷胱甘肽联系和二硫钝化物钝化保存酶特异性酶类中聚集,而在KEGG具体探讨一下中,这句话在柠檬百香果酸重复(TCA重复)、丙酸消化吸收和多动物群凋亡中聚集。在GO具体探讨一下中,m6A降低和mRNA调涨的表观遗传在胚胎骨骨关节特性产生、蛋白酶激酶特异性酶类更改密码和NADP消化吸收环节中聚集,在KEGG具体探讨一下中,m6A降低和mRNA调涨表观遗传在新霉素、卡那霉素和感觉神经营养物质细胞因素4g的讯号通道中聚集。

图5| m6A甲基化与mRNA体现的联手深入分析

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG定量分析

拜谱动物工作小结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生态学提供了m6A甲基化技巧服务培训,拜谱生物技术可提供完善成熟的蛋白酶组学、分解代谢组学、转录组学相应两组学综合厂品新技术精准服务,欢迎致电咨询!

学习文献资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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