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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿软件模式最喜欢见的病毒组成。肾策划 中CaOx氯化钠晶体过呈现饱和状态造成会使得肾小管内部挫裂伤和凋亡,而使使得肾结石的造成。短链乳酸酸由消化道内好氧菌日常细菌进行发酵饮食营养仟维导致,不只是在轮廓消化道第一道防线中利用效应,而在软件模式品质上也利用首要效应。至少,丁酸是最丰富多样的短链乳酸酸,有着免疫细胞治理和改善和免疫细胞治理和改善效应,本浅论浅论丁酸对CaOx肾结石的效应以及暗藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医阮泌尿整形外科吴忠博士生生导师、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠老师、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了电脑网络药剂学学产品,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

一篇文章品牌:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 客服公司的:华山医院口腔科 研究分析人群:大鼠、HK-2组织 排序产品信息:相较比较组(Con)、模型工具组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱带来了技术应用:网站临床药理学检查测量

难点注意事项图

实验结杲

实验相关人员首要倡导大鼠模形,借助顺利生化模式指标值和结构病理报告学染料等实验途径发展丁酸行以减少CaOx模形大鼠肾CaOx晶胞的达成和影响,有效改善CaOx模形大鼠的发炎影响和硫化东西的过度的展示。最后,丁酸还可调控草酸分析的HK-2血神经元影响、硫化应激状态和血神经元凋亡。 为探究性丁酸组成类型和靶什么是人类染色体互联网,科研员工从PubChem拿丁酸和丁酸酯的二维和三维空间组成类型(图1A)。采用PharmMapper大资料源和Uniprot大资料源通过处理后共建立出114个丁酸靶什么是人类染色体供进步数剧研究。将什么是人类染色体索引拷贝到STRING大资料源,通过PPI互联网数剧研究。Cytoscape如下了顺序排列的前20的核心站站靶什么是人类染色体的具体互联网图,包涵CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这么多核心站站什么是人类染色体与互联网中的其余什么是人类染色体均表达出千万的关与性,说明怎么写这么多什么是人类染色体应该充分调动着协同作战功用。GO和KEGG数剧研究论述了丁酸核心站站什么是人类染色体的关与路线和怪物学基本功能(图1C)。核心站站什么是人类染色体最一般的与类固醇皮质激素类回复、氧化的反响应激状态性回复、吸附性氧肿瘤细胞对类固醇皮质激素类刺激目的的反响或对含酸性化学工业的物质的反响关与。结合以上上述一系列的,这么多核心站站什么是人类染色体最一般的参加了氧化的反响应激状态性和对吸附性氧的怪物反响全过程,是肾结石组成管理机制中至关注重的路线,这表达丁酸应该在肾结石中充分调动注重功用。

图1| 丁酸设备构造与靶基因遗传电脑网络深入分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步骤宇宙探索丁酸对CaOx肾结石真实切靶dna,深入分享人工客服电话根据GEO数据报告统计库对GSE73680中更健康剖析与CaOx肾结石女性的dna差距来了深入分享。剖析组与CaOx结石女性的同质性能力差距展示出来dna(DEGs)检查标为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个dna发生了同质性转变,中间3379个(89.4%)dna展示出来上浮,404个(10.6%)dna展示出来再降(图2A)。对DEGs来聚类算法算法分享,热图屏幕上显示了前10个被选中DEGs的二维层次结构聚类算法算法特点(图2B)。随着,深入分享人工客服电话完成GeneCards数据报告统计库人工客服电话检验了370个机会与CaOx肾结石有关系的dna,名列前20位的预測dna及有关系性评分系统如同2C所显示。为了更好地搜到丁酸制疗CaOx肾结石的关键点靶点,深入分享人工客服电话将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系dna操作取到没事个Venn图。结果,CYP2C9被确实为丁酸引响CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。除外,深入分享人工客服电话还来了丁酸与CYP2C9的大分子合作,CYP2C9的这几个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸充分用途,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利用率网药理学学预測CYP2C9是丁酸决定CaOx肾结石的靶遗传基因后,论述人群还根据受损细胞系实验所灵魂存在了CYP2C9可下降草酸引发的HK-2受损细胞系的ROS水平方向、真菌感染直接损伤和凋亡。

图2| 很多据库结合浅析预估CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶表观遗传

探索结局

本科学研究第一个出现 丁酸在身体之外和体内的均能抑止CaOx肾结石模特的氧化反应反应应激反应性和疾病拉伤,继而利用微信网络上药学学建立的丁酸影向CaOx肾结石的不确定靶点——CYP2C9,结果利用神经元系实验报告否认CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2神经元系ROS水平方向、疾病拉伤和凋亡。这出现 反映出丁酸也许 利用抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的氧化反应反应应激反应性,消减疾病拉伤。这类整个过程中拜谱动物提供了了微信网络上药学学能力工作质量,不仅拜谱动物可提升较为成熟加强的DNA组学、血清质组学、分解代谢组学等多个学產品及能力工作质量,热烈欢迎转达咨询了解! 参考价值资料:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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