
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
学习但是
科学研究人士科学探究伴随冰箱的时长提高牛肉片片的对抗强度标准、持水力发电、成色、徘徊子铁含量的、ROS、脂质过被氧化物质、MDA、GSH和GPX4效率来评估方法相关肌肉组织安排生殖组织细胞的铁身故阶段。数据展现,冰箱的时长提高后,牛肉片片的对抗强度标准在第四天和第6天相关性变低;持水效率消减;样色变深,失却有光泽,鲜红颜色转化成暗红颜色。不仅如此,徘徊子铁、可溶性氧和MDA的含量的相关性增高,生殖组织细胞凋亡率相关性增高。 论述的人员拆分有差男人 冰箱事件的腹肌检样的血清质,随后实现SDS-PAGE探讨,血清质条带在有差男人 五代十国时期地域分布饱满且形似(图1a)。结合血清在有差男人 检样中的抒发状态,探讨知道不同条组检样的中六位数说出于不同条品质(图1b),介绍腹肌检样血清质具有着稳定的组内形似性和组间差男人性。 核胆固醇组学共检测出1996种核胆固醇。以B0为差表组,选择B1、B2、B4和B6中的核蛋清参与异同传达爱了解,共检测到375个DEPs。将火山图交互式,并只能根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05二个规则了解DEP。结局右图1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别检测出22、33、73和140个DEPs,这之中分刘海别调整6、11、32和84个,调整16、22、41和56个。聚类分析法的办法测评了各种不同冷冻阶段性胸肌组织结构中核胆固醇的传达爱,结局表示胸肌核蛋清传达爱异同随存贮日期的增强而增强(图1g)。
图1| 各个冷库時间的背部肌肉打样定制淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各个冷藏箱時间的背部肌肉打样定制区别蛋白酶分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁牺牲血清肽的PRM化学发光法定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 为KEGG生物富集对比把你想表达出来蛋白质的铁消失工作机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT酶联免疫法核高蛋白质组学枝术服务质量质量,拜谱菌物已科研开发进行并确立了进一步优化成熟稳重的转录组学、核蛋白质组学、基础代谢组学各类多个学合力货品枝术服务质量质量装修标准,欢迎致电咨询!
借鉴文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.